Waarom snijden de meeste restrictie-enzymen bij een palindrome sequentie?

Waarom snijden de meeste restrictie-enzymen bij een palindrome sequentie?
Anonim

Antwoord:

Omdat het efficiënter is.

Uitleg:

Enzymen zoals restrictie-enzymen moeten een zeer specifieke sequentie herkennen om zijn taak uit te voeren. Het bindt zich alleen in één specifieke configuratie aan het DNA. Gelukkig! omdat je geen 'pacman' wilt die op willekeurige plaatsen DNA snijdt.

DNA is dubbelstrengs, dus het heeft 'twee kanten' waaraan het enzym kan binden. Een palindrome volgorde is aan beide zijden naar achteren en naar voren (zie onderstaande afbeelding). Dit betekent dat het enzym de volgorde herkent, ongeacht vanaf welke kant het enzym het DNA nadert.

Een palindrome sequentie verhoogt ook de kans dat beide DNA-strengen worden afgesneden. Het is zelfs mogelijk dat twee enzymen werken als een dimeer om de palindromische sequentie te snijden, waardoor de efficiëntie verder wordt verhoogd.

De laatste reden was belangrijk in de strijd tussen virussen en bacteriën. Bacteriën zijn geëvolueerd om op bacteriën gerichte virussen (bacteriofagen) te 'uitschakelen' met restrictie-enzymen die binden aan deze palindromische sequenties. Het snijden van beide strengen DNA schaadt het virus meer dan het afsnijden van één streng.