Waarom GAPDH wordt gebruikt in Western Blot? + Voorbeeld

Waarom GAPDH wordt gebruikt in Western Blot? + Voorbeeld
Anonim

Antwoord:

GAPDH wordt vaak gebruikt als laadcontrole.

Uitleg:

Bij Western-blotting gebruiken we GAPDH vaak als laadcontrole. Wat dit betekent is dat door te onderzoeken op GAPDH we kunnen controleren of we een geladen equivalente hoeveelheid eiwitten op verschillende rijstroken van de blot hebben.

Een voorbeeld van gebruik - stel dat we een ziekte hebben waarvan we denken dat ze een verhoging van een bepaald eiwit in de cel veroorzaakt. We zouden een monster maken van "gezonde" cellen en een ander monster van "zieke" cellen. We zouden dan equivalente eiwithoeveelheden van beide monsters op een gel laden voor de Western-blot.

Na het onderzoeken van de vlek op ons eiwit van belang, vinden we dat in de zieke cellen het eiwitniveau inderdaad verhoogd is (dat wil zeggen dat een donkerdere band op de blot wordt geproduceerd). Om aan te tonen dat deze toename van het eiwit het gevolg is van een verandering van expressie in de cel, in plaats van een belastend artefact (dat wil zeggen dat de meer instabiele band wordt veroorzaakt door een verandering in eiwitexpressie in de cellen en niet door per ongeluk meer te laden) van het "ziekte" -monster dan het "gezonde") zouden we ook de blot voor GAPDH onderzoeken om aan te tonen dat de totale eiwitniveaus in beide lanen hetzelfde zijn.

Door dit te doen laten we zien dat equivalent eiwit in de twee rijstroken is geladen en dat de verandering in de bandintensiteit die we waarnemen het gevolg is van veranderingen in eiwitexpressie voor het eiwit van belang.