Wat is het probleem als de bands niet in Western Blot verschijnen?

Wat is het probleem als de bands niet in Western Blot verschijnen?
Anonim

Antwoord:

Veel…

Uitleg:

Er zijn veel redenen waarom bands mogelijk niet op een western blot verschijnen. Zijn de monster- en antilichaamcombinaties in het verleden goed gewerkt?

Hieronder staan slechts enkele die ik op dit moment kan bedenken waardoor bands mogelijk niet verschijnen:

  1. Is het eiwit uit de gel overgebracht? Probeer het membraan te kleuren met iets als ponceau S of amido black om te zien of de banden aanwezig zijn. Soms kun je de eiwitbanden op het membraan zien door het te bevochtigen en het onder een hoek met het licht te houden.

  2. Werkt het primaire antilichaam? Dit is moeilijk om te testen en de enige manier om dit te doen is door een positieve controle toe te voegen waarvan je weet dat je het eiwit van belang aanwezig hebt. Als u een deel van het interessante eiwit heeft, kunt u proberen het op het Western-blotmembraan te vinden (dat wil zeggen, u voert de gel niet uit) en te kijken of u een resultaat krijgt als u het membraan verwerkt alsof het een Western-vlek is.

  3. Is het secundaire antilichaam het primaire antilichaam? Nogmaals, een moeilijke test. Over de enige test die u kunt doen, is de puntentest hierboven vermeld in 2.

  4. Werkt het "detectiesysteem"? Afhankelijk van de detectiemethode die u gebruikt, kunt u proberen een deel van het secundaire antilichaam aan te wijzen om te zien of de detectieoplossing en ook het activerende middel / enzym op het secundaire antilichaam werkt. Dat wil zeggen, kunt u de reactie activeren met alleen het secundaire antilichaam?

Ten slotte kan het zo eenvoudig zijn als een van de oplossingen die worden gebruikt tijdens het onderzoeken van de plot verkeerd wordt opgemaakt. Als de zoutconcentratie bijvoorbeeld verkeerd is in de buffer, kan dit ertoe leiden dat de antilichamen uit de blot worden vrijgegeven. Hetzelfde zou ook gebeuren als de pH van de buffers onjuist was.

De "raarste" oorzaak voor een westerse vlek die niet werkte, die ik persoonlijk heb ervaren, was toen we de leverancier van het melkpoeder veranderden dat we gebruikten om het membraan te blokkeren. Het poeder van de nieuwe leverancier bevatte een fosfotyrosinefosfatase dat alle fosfaatgroepen verwijderde die we probeerden te detecteren met ons anti-fosfotyrosine-antilichaam.